人類曾一度慘遭巨人捕食而崩潰，瀕臨滅絕。幸存下來的人們建造了三面巨大的防護墻來阻止了巨人的入侵，在這隔絕的環境里享受了一百年的和平。不過作為“和平”的代價，人類失去了到墻壁的外面的“自由”，如同圈養的畜牲一般，安穩地生活著。主人公艾倫·耶格爾對還沒見過的墻外世界抱有興趣，同時也對人類失去的 “自由”抱有向往，不同于懼怕巨人且盲目相信墻壁能保護自身安全，而甘愿生存在墻內的大多數人類，他極想到墻外的世界去探險，也因為這種想法，人皆視其為異端。就在這悠長的安逸持續了一百年，也就是艾倫·耶格爾十歲那年之際，突然，一個前所未見、身高60米的“超大型巨人”出現在人類面前，他以壓倒性的力量破壞了巨墻，其后瞬間消失，巨人們成群地沖進墻內，人類慘成餌食。看到了人們、伙伴、母親先后死在巨人口中，他懷著對巨人無以形容的恨意，誓言全殲巨人。母親死亡、父親失蹤。其父可能掌握了巨人之謎，艾倫·耶格爾因父親而獲得了的“巨人之力”，在軍隊同期訓練生里有著其他人無法比擬的強悍精神力，雖然見過地獄，依然敢于向巨人發起挑戰，進而加入向往以久的調查軍團，艾倫的生活，就在這一刻，開始發生了翻天覆地的變化…
